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它们都是由DNA构成的,我们都是由相同的化学物质DNA构成的。
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为了庆祝今年即将结束,我们回顾了今年的遗传学和基因组学,并讨论了发布的顶级新闻和重大出版物。我想不出还有比这两个人更适合加入我的谈话了。这实际上是我们已经做了几年的一个系列节目。我们刚刚在11月初在丹佛举行的美国人类遗传学协会会议上回来。所以这很完美。
很高兴能邀请到ASHG的卸任主席,以及NHGRI(即美国国立卫生研究院下属的国家人类基因组研究所)的主任。如果我说错了,Eric会批评我的。
为了更多地了解我们两位令人惊叹的嘉宾,正如我所说,这是我们第二年邀请美国人类遗传学协会现任主席参加此次讨论。去年,我们邀请了Brendan Leon。今年,我们邀请了Bruce Gelb博士,他是一位著名的儿科心脏病学家和遗传学家,担任戈尔家族主席和西奈山明迪奇儿童健康与发展研究所所长,在那里他领导着先天性心脏病和努南综合征等遗传疾病的开创性研究。他是利用基因组学揭示儿童疾病病因的先驱,并获得过许多荣誉。
并且是美国国家医学科学院的成员。他还领导西奈山的心血管遗传学项目,并且是全球儿科研究领域的领先声音。Gelb博士,非常感谢您前来。至于我甚至不知道你参加过多少集节目,Eric,这是Eric Green博士,正如我所说,他是美国国立卫生研究院下属的国家人类基因组研究所的主任。他的职业生涯包括指导许多主要的基因组研究
研究,包括人类基因组计划,并领导NHGRI资助基因组学研究的工作。这有多重要?这是我们第三年一起做这个节目了,Green博士。是的,我只是喜欢能够做这个。我会说这更随意一些,因为我们都会分享过去一年发生的事情。我的想法只是来自丹佛的雪地会议,
Gelb博士,在我们结束今年的时候,你也要结束你的主席任期了。你能分享一下这次会议对你来说是什么样的吗?以及今年担任主席的一些想法,以及你开始回顾的一些想法吗?当然。这是
忙碌的一年。就丹佛而言,我先表达感激之情。这是
30英寸的雪错过了市中心。所以我们在那儿很冷。所以我们能够进进出出。我得到错误的统计数据了。不,不,不。山区大约有30英寸。我们听说过。所以当地通勤者很艰难,但我们其他人还好。你知道,我在我的总统演讲中说,我认为我们仍然离COVID
足够近,能够真正欣赏能够聚在一起的美好。我认为当你来到会议中心时,你会非常强烈地感受到这一点。我认为人们很高兴能够在一起。科学做得更好。这是一种社会行为。这是一项人类社会活动。你需要接近。我认为我们能够聚集在一起这一事实非常重要。
我自己的,我的意思是,至少对我个人而言,最精彩的部分是发表总统演讲,这是一个巨大的荣誉,坦率地说,感觉像是压力山大。我选择的主题是人类遗传学领域的人们都很熟悉的,那就是变异表达和不完全外显率。我选择它是因为我相信,并且我希望至少能说服房间里的一些人,
所以这些概念已经变得更加紧迫。我们正在进入一个领域,我认为这反映在我们稍后将要讨论的一些论文中。这当然也反映在我们会议期间的科学研究中,增加了利用遗传学进行基于人群的筛查的机会。
目标当然是一个美好的目标,那就是找到那些有各种健康问题风险的人,我们可以做些什么来解决这些问题,并在他们的健康状况真正恶化之前发现这些问题,让他们保持健康,或者至少减缓这一过程。这是一个美好的想法。
但它却碰到了一个问题,这个问题会因我们谈论的遗传疾病而异,即我们目前在人类遗传学中所了解到的,这些知识是通过研究患有该疾病的个体或他们的近亲(他们的兄弟姐妹、孩子、父母)获得的,这让我们了解了人们随着时间的推移患上遗传疾病的可能性。
但正如我们在研究大型人群生物库(如英国生物库、现在我们所有人)时一次又一次看到的那样,
以及那些存在于各个医学院的生物库,实际上,根据拥有正确的基因变化而患病的比率远低于我们之前所理解的。这对于我们如何推出这项技术以及我们需要了解哪些信息才能确信某个特定性状值得在人群中进行筛查具有真正的意义。
所以这就是我在演讲中的根本信息。我还想说,在会议上,我们有一个由主席组织的研讨会,这是第二天的事。我的演讲是在星期二,你知道,就在选举之前。投票开始在东部地区结束。是的。但我感谢能够完成它。然后第二天是研讨会。我们有三位发言人,他们的主题与之相关。我很快就会说他们是什么。一个是。
一位优秀的历史学家Greg Raddick,他是美国人,目前在英国,他正在谈论这种关于孟德尔疾病(所谓的单基因性状)是复杂还是简单的论点,这可以追溯到20世纪初。想象一下,如果我们认为孟德尔疾病
是的,这是一个很好的演讲。我正在疯狂地做笔记,它真的让我开始思考。
所谓的简单的孟德尔疾病以不同的方式。这只是那些,是什么?那是三个演讲,都是相关的。这太棒了。所以我们对这次会议做了一个回顾性节目,那是第314集。我谈到了这一点。Raddick博士实际上最终听说了这件事,并且说,谢谢你。所以就像,哇。
我说,好吧,我们必须让他做一个完整的节目。我得先读他的书。所以,你知道,在假期里,我会有很多时间去做,因为我认为这是一本比较长的书。但我对此感到兴奋,因为这对我来说是一种非常有趣的心态。
是的。好的事情是,他描述了一个真实的实验,他们试图用更复杂的版本而不是简化的版本来教大学生。最后,他们培养出对事物有更细致入微的看法,并且在他们的思维中不太具有基因决定论的人,我认为这是一件好事。所以这很酷。第二个演讲者是Athena Davenport,她是ASHG的成员,现在领导我们的DEI小组。
一个委员会。我们刚刚成为ASHG的一个委员会。她谈到了镰状细胞病的遗传修饰因子。我们没有那么多孟德尔疾病,我们知道修饰因子。这里有一个我们了解很多的地方。它已经被用于治疗目的。所以这很令人兴奋。还有更多的事情要做。所以这是一个令人兴奋的演讲。然后最后是一个
我的一个朋友,实际上是普林斯顿大学的Scott Schwartzman,他做的是定量基因组学,主要使用果蝇,他正在用它来研究随机性,这也在人类的变异性中起作用,而我们对此几乎一无所知。
实际上。我们只知道它存在。每个人都说,是的,它存在,但我们并没有过多地考虑它,当然也没有。它很难研究。所以我认为作为一个整体,它进入了,我知道会议上有很多人走过来,对他们听到的内容感到兴奋。特别是对于那些正在考虑这些事情以及如何规划自己职业生涯的年轻人来说,我认为有很多
我可以确信,这将使遗传学家在未来100年或200年里保持忙碌。你知道,有很多事情要做。是的。让我插一句。从我的角度来看,关于这次会议的一些事情。首先,我想亲自祝贺Bruce,因为我认为他的总统演讲非常出色。他刚才描述的发言人的总统研讨会。
真的,只是展示了一些非常重要的作品。我喜欢ASHG会议的一点是,每年主席们都能留下自己的印记、风格和兴趣。你知道,它只是在一个非常公开的论坛中获得了一个机会,来真正奖励主席。
为他们的服务,通过,你知道,给他们一个机会真正说出他们对感兴趣的科学领域的看法,但也展示他们真正感兴趣的领域。所以,你知道,我个人祝贺Bruce担任主席,也祝贺他在会议上所做的一切。当然,他首先会说,他站在数十甚至数百人的肩膀上,这些人共同组织了这样一个会议。这绝对是针对,你知道,Bruce所做的事情,以及ASHG作为一个组织所做的事情。我认为这很棒。
这是一年充满挑战的一年。显然,选举分散了注意力。雪也分散了注意力,你知道,有时这会让一些人感到紧张。但是,你知道,科学只是,对科学的热情只是非凡的。我在会议上向几个人指出了这一点,我只是觉得,也许我之前在这个播客上也谈过这个话题。我不知道。但我不断惊叹于我每年去ASHG时的一件事,那就是基因组学完全融入到会议中。也许有些人会说,好吧,当然,基因组学应该融入人类遗传学会议中。但这可能是因为我年纪大了,也可能是因为我还在的时候,伤痕还在隐隐作痛。但如果你回顾一下,时间并不长,但如果你回顾人类基因组计划的早期,
基因组学并没有真正受到ASHG会议的欢迎。那里存在分歧。我们在展览厅聊天,我可能占用你太多时间了,Eric,但就像我们谈论这个概念一样,我并没有完全,我以前听说过。
但你给了我很多信息,那段时期很艰难。那时并非所有人都相处融洽。有一段时间是遗传学与基因组学的对抗。起初,人类遗传学家只是,他们担心他们会议的身份。他们对这些关于人类基因组计划的大型基因组学演讲并不十分欢迎。我不知道所有社会学的原因。
Kira,你不会知道这件事,因为你太年轻了。我发现这令人震惊,因为基因组计划开始时,我只是一个博士后研究员。我之所以讲述这个故事,是因为这是真的。这是我唯一一次担任ASHG委员会成员的时候,当时我是一个资深的博士后。也许我刚成为一名助理教授。所以大概是1992年或
左右。情况变得非常紧张,项目委员会似乎对如何融入基因组学感到非常不确定,所以我被邀请加入项目委员会。所以我是在一个非常初级的阶段加入项目委员会的,因为他们认为我可以进来,而我仅仅是被要求,告诉我们基因组学中最好的东西是什么,我们应该尝试展示什么?所以我帮助招募摘要,挑选摘要,主持会议等等,
我想说的是,这一切都是历史了。一切都消失了。现在,如果你沿着那些海报展板走来走去,或者去ASHG的任何一个随机会议,你都会发现遗传学和基因组学完全交织在一起。它不再有任何部落式的特征了。你几乎会嘲笑曾经存在任何冲突。但确实存在过。谢天谢地,我们已经过去了这个阶段。这是一个美好的,美好的会议,可以
大致了解基因组学的应用是如何真正提升人类遗传学、医学遗传学等等的。
确实如此。这是我第一次作为一名遗传咨询师参加。我已经参加了国家遗传咨询师协会的会议,我想已经有五年或六年了,包括我在家进行的虚拟年份。所以这就是我习惯的。对。然后这次会议规模要大得多。我在展览厅遇到了很多我甚至不知道存在的公司。Green博士,当我们进行那次谈话时,我抬头一看,我说,是的,你可以在展览厅里看到很多次“基因组”或“基因组学”这个词,哦,这家公司和那家公司。所以它确实也融入了所有演讲的内容,以及展览厅的海报展板。我认为那里有很多东西。
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遗传学和基因组学中发生的事情。很多事情都归结为什么是最重要的出版物?当我们开始这个系列节目时,我认为三年前,我联系了Green博士。我说:“嘿,你是一个很适合和我一起做这件事的人。我们该如何确定要谈论什么?”你说:“嘿,我们实际上已经做了所有这些工作,并确定了基因组医学年度回顾。”我说:“哦,太好了。这可以作为这次谈话的模板。”
那么,Green博士,您是否想提供更多信息,例如,就你们两人而言,与更大的团队一起撰写这篇论文的背景?因为这是每年发表在美国人类遗传学杂志上的内容。当然,这是美国人类遗传学协会的杂志,这也带来了另一种联系。虽然我想强调的是,我即将要描述的年度回顾只是关于基因组医学的实施。这是人类遗传学的深度和广度。
所以,我还认为我们应该确保讨论今年人类遗传学中非常酷的事情。非常酷。这是一个彩蛋。对不起。这破坏了很多。顺便说一句,Eric,如果我没有注意到这是我们的两本期刊之一,我就没有尽到我的职责。说得对。
是的。我们会将我们引用的所有内容的链接添加到节目说明中,因为我知道我们正在抛出很多首字母缩略词和不同的期刊。和以往一样,年度回顾背后有一个故事。这个故事很简单,那就是在我成为NHGRI主任后不久,我即将庆祝我的15周年纪念日,实际上不到一周的时间。
到这一集播出的时候。
标题中使用了基因组医学。它代表了我成为主任的标志性特征,我将开始扩大我们的投资组合,将基因组医学研究作为研究所工作的一个关键部分。当我们发表这一战略愿景时,我的最高级别咨询小组(国家人类基因组研究咨询委员会)所做的第一件事就是,这是研究所的最高级别咨询小组,
我们成立了一个工作组,专门关注基因组医学的实施。这个工作组从那时起就一直存在。它被称为我们的基因组医学工作组。
这个小组每月都会开会,我也会和他们每月开会,他们做了各种事情。但随着文献在过去几年中不断增长,现在大约已经有13年了,他们开始,你知道,我们开始整理论文,并建立一个网站,讨论我们认为基因组医学中最大的成就是什么。所以在大约19年的时候,
我认为可能是Bruce Korf联系了我们,或者可能是我们联系了他,我不知道,因为他当时是美国人类遗传学杂志的编辑。他说,为什么不选择你们今年的十大论文并撰写一篇呢?所以……
我们做了。我们开始了这项工作。所以现在我们收到了美国人类遗传学杂志的长期邀请,在他们的2月份和12月份的刊物上提交一篇相当简短的论文,我们挑选,我们投票,这是一个选择我们认为基因组医学和基因组医学实施方面十大论文的整个过程。所以这随时都会出来,因为它会在
当这个播客播出时,它将发表在美国杂志上。这也作为对今年的回顾,看看今年文献中出现了什么。所以我们有最新的即将发表的论文。它被称为《2024年基因组医学年度回顾》,其中包含10篇论文。
这非常有帮助,因为我认为在12月份,我们都在以不同的方式回顾这一年,以及我们领域的方面。所以我的问题可能很难回答。
哪一篇是你的最爱?我们面前有10篇。我们从哪里开始?所以我会在政治上回避这个问题,对这个问题进行分类,每当人们问我我最喜欢的孩子是哪个的时候。所以它们没有顺序。它们只是,这是前十名。是的,我明白了。我必须尝试一下,对吧?我必须稍微煽动一下。你可以试试。我想说的是,当我回顾过去时,
我,你知道,我看过,我读过论文,我编辑过论文。我是这篇论文的合著者。但为了今天与你和Bruce的谈话,我退后一步。我发现有两件事让我非常高兴,原因不同,但它们确实让我很高兴。第一,如果你只看每篇论文标题的标题,那么“多样性”或“血统”这两个词在10篇论文中有4篇中出现。
我认为这真的,真的很好,因为它反映了这样一个事实,即这个工作组的十大出版物中,当然,这只是一个投票系统。我相信我们可以让其他人想出不同的十篇论文。但仍然是佼佼者,这些论文中的佼佼者,其中四篇的重点或主要部分与人类多样性、人类血统有关。我认为这令人难以置信。
然后同样,另一个,好吧,许多批评之一,当你是NIH研究所的领导者时,你会一直受到批评,这很好。我们脸皮厚,我实际上喜欢辩论。我喜欢听人们怎么说,
当我做演讲时,我会经常听到人们说,你知道,你谈论基因组医学太多了,我们需要在非医学领域使用基因组学。它应该更多地关注预防。我们可以做些什么来预防疾病?而且,你知道,这整个争论就是我们是否应该称之为精准健康?我们是否应该称之为精准医学?我们是否应该关注医学,医学是关于对病人进行干预,而不是关于健康和预防?所以,我的意思是,所有这些年来一直被医生、公共卫生官员等等争论不休。
但忘记标题吧。如果你真的只看这10篇,我的意思是,其中6篇确实与预防有关。
而不是也许它们确实是关于预期基因组学的。也许这甚至是我从未想过的一个词组,但它确实是关于使用基因组学来预测的。我认为这真的很好,因为它消除了过度关注使用基因组学的医学干预的批评,因为它们谈到了真正为我们预防做好准备的事情。所以我认为这也显示了我们领域的进步,对吧?那就是我们
在这个领域发表的一些最有影响力的论文是
具有这些重点,因为我们回顾过去,显然你们两人比我更有远见。但是回顾过去,就像我们开始人类基因组计划时,看看其中包含哪些基因组,以及很多早期的数据库,很多都是欧洲血统。而这正是我在节目中以及其他嘉宾反复谈论的事情。Green博士,你也在节目中谈到过这一点。我认为这非常重要,
我们正在取得进展。有时我会在这个节目中抱怨,我们的进展不够快,但是,让我们退一步,庆祝我们取得的进展,因为进展正在发生。我只是不耐烦。我希望进展非常快,但它正在发生。我认为这很重要。Gelb博士,你对这10篇最优秀的论文有什么想法吗?是的,我非常同意Eric刚才的评论。
我的意思是,我不会说这是我最喜欢的,因为我理解政治,但其中一篇特别能说明你所谈论的问题,那就是一篇来自NIH资助和NHGRI资助的联盟eMERGE的论文,其中eMERGE 2,他们试图做的是将多基因风险评分应用于不同的人群。因为我们都知道
多基因风险评分是基于GWAS的,而GWAS不幸的是,绝大多数都是用欧洲血统的人进行的。然后,所谓的可移植性问题就出现了,即当你试图将一个在欧洲血统人群中开发的PRS应用于非洲血统人群时,你最终会发现效力很低,预测效力很低。
因此,人们正在努力研究这个问题。令我印象深刻的是,在这篇论文中,他们对哪些性状可以进行研究,哪些PRS在应用于其他种族时有效,以及它们的有效性如何进行了很好的思考。你可能需要根据他们的种族背景告诉人们一些不同的事情,但这通常是可行的。我很兴奋。我的意思是,这只是一个开胃菜,对吧?就像……
主菜将在他们实际应用它之后出现。他们才刚刚开始招募和应用。所以我们将拭目以待。但我们看到的一点点数据,我认为他们招募并测试了大约2500人,让我们对它将是什么样子有了一点了解。我认为这将非常令人兴奋,并且对于推广基于PRS的公共卫生方法非常有益。艾丽卡,这是来自“我们所有人”的数据,对吧?
他们使用了“我们所有人”的数据。这就是我的意思。抱歉。他们使用了一些数据来验证他们的模型,因为“我们所有人”项目当然非常多样化。因此,如果你想问一个问题,PRS是否适用于一个多样化的群体,这是一个很好的地方。他们主要就是这样做的。而且总的来说,他们只保留了那些有效的结果。顺便说一句,布鲁斯刚刚指出了一个非常重要的点,我认为这与我之前所说的看到更多预防措施有关。我的确认为
多基因风险评分,你在美国人类遗传学协会会议上看到了这一点,多基因风险评分,对它们的关注非常热烈。非常热烈。它引发了许多关于预防可能性的问题,也引发了许多关于数据在多样性和种族方面不足的问题。这就是为什么这个问题正在被讨论的原因。在美国人类遗传学协会会议上进行了大量的、严格的辩论
关于我们是否真的会看到多基因风险评分的成果。我认为合理的人可能会意见不一。一些人比较乐观,一些人比较悲观。但布鲁斯说得很好。这只是对接下来会发生什么的开胃菜。我们并不完全知道。但显然,正如布鲁斯指出的那样,它来自我们资助的一个联盟,因为我们相信这是一个非常重要的研究领域。其他人也在资助。
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是非常异质的。如果我们对工作组进行一些回顾性分析,情况就会更加如此。如果你回到2015年、2016年,在我们开始发表论文之前,即使你看那些论文,它们也更加同质,可以被归类为基因组医学实施论文。现在它变得更加异质化了,这很好。这实际上是你想要的。
是的,确实如此。所以,埃里克,我认为你现在必须选择一篇论文来谈论,不是你最喜欢的,只是你从这个列表中知道的。你知道,这不是我最喜欢的,但我认为,你知道,其中一些,
只是引起了我的注意,因为它们确实展示了进步的飞跃。我的意思是,即使是列出的第一个与血色素沉着症有关。我的意思是,我们已经在许多情况下谈论血色素沉着症很久了。而且,你知道,我可以考虑在GINA项目期间的进展在哪里,我认为
在基因组计划期间可能是基因被发现的时候。现在,在完全不同的背景下,你实际上看到了现代基因组学如何从遗传学的角度对管理这种疾病有用。所以这个肯定引起了我的注意。我在想其他的。
至少有一篇论文谈到了品牌。你要说什么,布鲁斯?你一直在跳。我只是想对血色素沉着症插一句。我认为这将有助于可能没有阅读过它的听众理解这里潜在的力量。当他们识别出从基因角度来看应该
有血色素沉着症风险的人时。首先,大约30%的人已经有了诊断,所以它已经被发现了。但在剩下的这些人中,有两件事脱颖而出。其一,在那些随后接受评估的人中,有一半人被发现患有这个问题,大多数人大约
你知道,他们中的三分之一接受了治疗。所以,你知道,无论是定期抽血还是螯合疗法。所以这是一件相当大的事情。但另一件事是一个实施问题,因为
几乎三分之一的人,即使他们被告知他们有血色素沉着症的基因,也没有接受评估。这是我们在医学上必须努力改进的另一个领域。不是每个人都会听到这个消息,然后立刻行动。这也是一个错失的机会,因为这些人中的一些人会生病,而这本来是可以避免的。我们该如何解决这个问题?所以这里有一个重要的实施要点。
这是一个群体,因为它是在宾夕法尼亚州的农村地区,那里的人们往往比纽约这样更愤世嫉俗的地方更倾向于听从医生的建议。所以我们必须仔细考虑这个问题。我们必须仔细考虑这个问题。顺便说一句,我可能还会提到另一个,我讨厌在这里挑选最喜欢的,但如果你把这份清单给一群高中生,我经常会收到高中生的联系。
他们喜欢CRISPR。好吧,我和高中生们站在一起。这是我必须谈论的一个。是的。我的意思是,他们为什么不应该呢?因为这是……我的意思是。所以关于用基因编辑治疗视网膜疾病的故事。我的意思是,你知道,越来越多的这样的故事出现了。但是,你知道,这真是非凡的。
是的。去年,格林博士,我个人最喜欢的是FDA批准的用于治疗镰状细胞病的CRISPR疗法。然后今年我们邀请了维多利亚·格雷,她是第一个接受治疗的人,自2019年治疗以来一直没有症状,也就是五年前。所以我今年的节目中有很多集都关注
关注CRISPR,特别是FDA批准的治疗方法。我经常在采访和其他场合提到它。所以现在又有一个,你知道,我们有这篇关于用CRISPR-Cas9和基因组编辑治疗这种遗传性视网膜疾病的论文,这非常有趣。而且,我一直在学习更多关于这方面的信息。这是儿童中最常见的遗传性失明疾病,你知道,任何与儿童有关的事情都会牵动我们的心弦。
我可以插一句吗,卡拉?是的,请便。同样,对于没有读过它的人来说,这是一项一期二期研究,这意味着他们只是在观察它是否安全。然后他们会看看它是否有效。因为他们不确定它是否安全,剧透警告,结果证明它是完全安全的。但他们为每位患者选择他们病情较差的眼睛。
然而他们仍然看到了好处。所以我就在那里想,我们多快能把这些东西放进那个人的另一只眼睛里,并试图保护所谓的好的眼睛,它可能也正在经历视力下降,但只是没有那么严重。再说一次,这是一个开胃菜,因为我相信他们将继续进行二期和三期试验,以获得FDA的批准。但是
但事实上,他们已经看到一个明确的信号表明它在一项真正旨在证明它安全的试验中有效,这通常是治疗开发中一个非常好的迹象。所以这非常令人兴奋。
这是我们将关注的一个方面,好吧,临床试验进展如何?然后显然要庆祝一下,你知道,我期待着在某个时候获得FDA批准的治疗方法,就像我们对镰状细胞病那样,因为任何与CRISPR相关的事情都非常令人兴奋。我认为这是,
这发生的速度有多快。我们在2012年开始了这个节目。所以12年前,我开始了DNA Today,2012年有一篇重要的CRISPR论文。在过去的12年中,我们取得的进步,就像我现在所处的位置一样,我将在50多岁、60多岁的时候。我29岁。对我来说,这发生得如此之快。我不知道你们是否也有类似的看法,就我们能够多快地将CRISPR用于治疗,而不仅仅是在研发方面,
方面的事情,以及了解CRISPR。我的意思是,这仍然让我难以置信。如果有人说,你想谈论什么话题?那总是CRISPR。我将要做的类比是,顺便说一句,
听到你说你的年龄让我很痛苦,但没关系。我知道。我知道。好吧,你提到我一开始很年轻。所以那些通常不听节目的听众,你通过说,你知道,这段时间,但当然你在这个星球上,但你知道,我的反应,你知道,当你这么说的时候,当你这么说的时候,我也有完全相同的本能反应,但不是关于CRISPR,而是我有本能反应,因为我从未想过在我的,因为我从事基因组学,
作为一名病理学住院医生,参与了基因组计划。即使在基因组计划,即使在我们21年前对第一个人的基因组进行测序时。如果你告诉我,在我有生之年,我们可以以不到1000美元的价格常规地对患者的基因组进行测序。我会,不可能。不可能。现在,我不29岁,我两周后就要接近65岁了,但是……
我真的从未想过我会看到我们现在已经看到的常规基因组测序。而且我认为它甚至会,我认为,只会更多。但我知道你到底是怎么想的,因为当我回顾过去的时候,这正是我回顾过去的东西。我无法相信在我的有生之年,更不用说我的职业生涯了,我们已经将基因组测序作为临床护理的一部分。
自从我们完成人类基因组计划以来,只有21年时间,比如在03年的时候,这是一个很大的,你知道,所以这很了不起。盖尔博士,你要说什么?是的,我要做一个对比,因为当我90年代初在这里在西奈山开始我的职业生涯时,基因疗法即将发生,对吧?这是真的。现在,有些事情是我们担心的时间可能会花费,而且它增加了挫折。
而且可以肯定的是,我认为CRISPR疗法在某种程度上是建立在它的基础之上的,因为一些经验教训在它们前进的过程中是适用的。但我同意,CRISPR从发现到治疗批准所花费的时间是惊人的。而且这仅仅是一个开始,你感觉到了。是的。
对于这种疾病,据我所知,没有好的疗法。所以这真的非常重要。这令人兴奋。不,这是一个很好的观点。我认为90年代,据我所知,就像基因疗法一样,哦,我的天哪,这是正在发生的事情。这太棒了。
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再说一次,我们不是按顺序进行的。这有点像,你知道,非常……布鲁斯,哪一篇论文特别吸引了你?好吧,我只能指出,其中一篇论文正在研究……
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这是一个很大的兴趣,人们已经思考这个问题一段时间了。基拉,我可以插入今年对我来说不是论文中内容的一个惊喜吗?一个小小的额外内容。我喜欢。不,我实际上会把它加进去。因为再次,在准备这次讨论时,我一直在想,今年我的最大惊喜是什么?或者是什么真正引起了我的注意?
其中一件事情,实际上我可以说几件事情,但其中一件事情,我认为基于我们刚才关于CRISPR或基因组测序所说的话,你知道,我们认为10年后、20年后我们会处于什么位置?它会比我们想象的更快吗?它会比我们想象的更慢吗?等等,等等。我被邀请到纽约市一个离布鲁斯办公室三个街区的地方参加一个会议,关于
新生儿测序国际联盟,这个ICONS小组。实际上,当我去参加那个会议的时候,我和布鲁斯在一个早上一起吃了早餐。我从未参加过那个会议。它的全部特点是新生儿测序,既针对
患病的,也针对健康的新生儿。在过去,随着DNA测序成本的降低,关于这一点的讨论也越来越多,就像,你知道,我们是否应该对健康的新生儿进行测序,而不是像现在这样进行常规的遗传筛查?我想说的一件事是我从那次会议中学到的,我真的很惊讶地了解到,印象深刻地了解到有多少
世界各地正在进行的研究。我的意思是,美国有一些研究,但在世界各地有很多研究。我的意思是,我知道英国正在做一些这样的事情,但还有很多。这是一个正在发展的研究领域,我认为这是一个非常有趣的研究领域。
而且我认为这也是那些事情之一,你知道,你几乎想让人们现在下注,你知道,我们什么时候会有大多数美国人或选择你想要的任何国家的新生儿进行基因组测序?是什么,你知道,我认为合理的人可能会对此有很大的分歧。
而且我认为,但我对正在进行的那么多研究印象深刻。我还想说,尽管我去年也说过这一点,但对重症新生儿进行基因组测序的想法,现在完全有道理了。三小时多一点的记录,就像,你知道,这太疯狂了。我想插一句。所以我认为强调这一点非常重要。作为主席,当我去国会山会见工作人员时,我一直在谈论这个问题。我谈到了这一点,因为
我认为我们面临的一个问题是,尽管这里每个人都理解人类基因组计划取得的成就,但你仍然会在外面听到这样的说法,
这有点失败了,对吧?就像,告诉我你改变了医疗保健的地方。对我来说,现在,我们正在改变全国乃至全世界的NICU,对吧?就像,基本上,现在,有一些NICU正在进行快速基因组测序,还有一些NICU将要进行快速基因组测序。仅此而已。
因为它是具有变革性的。我们正在对我们从未在NICU中进行诊断的罕见疾病进行诊断。这是全职的临床工作。我们已经超越了研究。这不再是一个争论。付款人也正在接受它。当然,成本持续下降,这使得更容易。我只是认为这是对……
人类遗传学和基因组学的一个巨大胜利,我们必须继续唱这首歌,因为当我们遇到关于我们做了什么的阻力时,这是一个令人难以置信的故事。而且可操作性是合理的。由于此原因,人们的生活发生了改变、被拯救和改善。而且它具有变革性。2024年是我开始说的一年,我现在在我的许多演讲中都说,我的意思是,基因组学拯救生命。我的意思是,我
你可以围绕其他许多事情争论,基因组学的应用,但你会得到这些故事,这些重症新生儿进行基因组测序,拯救了他们的生命。基因组学拯救生命。是的。由于我们对研究感兴趣,还有很多事情要做,因为事实上,当你应用这项技术时,你会发现40%的病例。我来告诉你,另外60%的病例不是环境因素,对吧?就像
我会说几乎所有这些都是遗传的。我们只是还没有能力弄清楚这一点。我们将如何实现这一点,我不知道这将是通过长读长还是更好地理解非编码区域,或者其他什么,但这将使我们忙碌起来。但我认为我们将看到持续的改进。它已经很好了,但在未来十年中将会变得更好。儿童早期基因组信息的效用也将如此。我认为……
除了正在进行的所有研究之外,很多人把麦克风放在我面前,说,在我们开始常规地对新生儿的基因组进行测序之前,需要什么?我说过的一件事是,当我们展示足够有用的信息时,我认为父母会开始自掏腰包。
如果我们有足够好的、有用的信息,这将对儿童和保持儿童健康有用。所以无论如何——
我会那样做。为什么不呢?所以,尽管我是一个研究项目的首席研究员,埃里克提到的其中一个研究,但我认为进行这项研究非常重要。我认为我们必须以一种非常
开放的态度看待它,并确保我们正在关注我们在健康方面取得的正确成果,而不仅仅是遗传学方面。这里的风险是我们只是说我们发现了X百分比的孩子,3%,基于遗传学,并假设我们是英雄,而时间会证明实际上只有很少的孩子有健康问题。这将是区分健康和遗传发现的关键。这与我的……
看到所有这些国际研究有关,因为布鲁斯是对的。这是研究。我不是说这不是临床注释。这是研究。事实上,世界各地不同的医疗系统中正在进行各种各样的研究,这很好。让我给出我从2024年获得的第二个“啊哈”时刻,如果那是它的意义,或者只是另一个惊喜,那就是我,
我相当有规律地,尤其是在疫情爆发之前,现在在疫情爆发之后,自从我成为主任以来,我试图进行一些国际旅行,以了解世界各地基因组学的发展情况,现在越来越多地了解世界各地的基因组医学的发展情况。今年我碰巧在7月的第一周去了澳大利亚,我曾在2012年去过那里。所以我等了12年,
12年的变化有多大。令人惊叹的基因组数量。首先,在2012年,他们几乎没有谈论基因组医学。他们正在谈论将基因组学建设成为一个企业,而不是基因组医学。12年后,他们正在做一些很棒的事情。而且有很多真正非常棒的工作正在进行。
我不是说其他国家也是如此。还有很多其他国家,我会访问其中的一些,而且我会继续访问。但我真的想强调的是,你知道,美国正在发生令人惊叹的事情,但同样令人欣慰的是,我们正在从其他国家学习的努力的数量。我真的很想看到这一点,因为我也认为基因组医学的实施是
很大程度上取决于它的工作方式等等。我们需要看到它在各种类型的医疗保健系统和文化中得到实施。是的,不,我认为这非常重要。在我们结束时,我们是否想再选择一篇论文,或者盖尔博士,如果还有其他像埃里克那样的事情,好吧,这是今年让我感到惊讶的事情,专注于?
好吧,我必须这样做,因为其中一篇论文是我共同资深作者之一的论文。所以我们必须做那篇。它是由埃里克的研究所资助的一项研究。就是这样。它是CSER联盟的一部分,即临床测序证据收集研究联盟。在纽约,我们有几个机构一起开展名为NYC ITSEE的项目。
其中一篇论文是关于我们开发的一种名为GIA的工具,在西班牙语中意为“指南”,它被设计用于结果的返回。最重要的是,我们证明我们可以改进结果
父母对理解的感知。特别是,我们为这项研究服务了一群非常多样化的患者及其家人。例如,我们在自认为是西班牙裔的人群中做得特别好。我认为这项研究很重要的原因是,正如论文中指出的那样,正在进行大量的努力来做这种常规的测试前工作,它只是迭代的。
弄清楚如何在规模上返回阳性结果,这是尚未进行充分研究的事情。在这里,我们进行了一项随机研究,并显示出益处。我认为我们将会需要,我不是说GEE将会是最终的答案,但任何方面都不是,但我
我认为,如果我们相信基因组医学的愿景,基拉,你知道这一点,将永远没有足够的遗传咨询师能够花一个小时的时间来向每个人返回结果,特别是如果我们正在进行人群筛查的话。因此,考虑如何以可扩展的方式,以人们可以访问的方式来解决这个问题,是我们需要继续做的事情。所以,再次强调,这是一个开始,而不是结束,但我认为这是一个重要的主题。这就是我提出这个问题的原因。
赫拉,今年对你来说最大的惊喜是什么?我的意思是,这是一个好问题。我认为我们已经涵盖了……
我们涵盖了很多内容,但我认为我会回顾NICU中的快速测序。我的意思是,这只是……甚至只是那里的投资回报率,不仅仅是我们为孩子获得诊断并挽救他们的生命。显然,这将是最大的。但我无法想象每天一个婴儿在NICU中的费用有多高。能够在不到……的时间内获得他们的诊断
成像以及所有这些不同类型的,你知道,试图达到诊断奥德赛的终点,仅仅从财政投资回报率来看,这怎么能不节省那么多钱呢?我认为正如盖尔博士提到的那样,这就是为什么保险公司开始说,哦,等等,我认为我们应该参与其中。所以我认为,我认为这是其中的一部分。但是,是的,任何与CRISPR相关的事情通常也会是我的答案。但我想感谢你们两位
感谢你们在这个繁忙的假日季节抽出时间来和我一起讨论这个话题。我每年都很喜欢做这一集,埃里克,非常感谢你每年都来帮我组织这一集。我现在非常关注2025年,我们将在这些领域看到什么进一步的发展。但我认为,特别是正如我们一开始所谈到的,绝地倡议等等。所以非常感谢你们两位。
谢谢你,卡拉。布鲁斯,再次祝贺你取得了伟大的成就——是的,祝贺你。埃里克,谢谢你让我和你合作。这真是太有趣了。
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